令人鼓舞的却又带点苦涩的发现

老包

生物医学知识整合论（BMKI）一书对认知和知识的本质作了较为深刻的研究和分析，得出了一些令人鼓舞的却有又带点苦涩的结论或发现。

优美无比的逻辑典范欧几里德几何和欧氏空间倾倒了世上无数逻辑学爱好者（包括学生时代的作者），世上的一切最终都可以解释为那个没有体积的无高无长无宽的“点”的行为，这是逻辑学家或数学家们的终极梦想。其实以粒子物理为代表的整个现代科学的最根本的哲学信念也在这里，相信总有一天基本粒子的行为可以解释整个世界，包括复杂无比的生命及其进化。
   
生物医学知识的整合是人类一个永恒的课题，但我们对这个重大问题的认识却是极其模糊的，特别是一些我们的基本信念所依赖的一些深层原理。以粒子物理问世为标志的现代科学踌躇满志，认为人类终究能以粒子规律解释一切，包括生命，健康和疾病，这促成了量子生物学，分子生物学（虽然这些名称多少有些名不副实）的问世。

BMKI无法回避这一根本问题。究竟粒子规律和行为能否解释生命，这是摆在生物医学知识整合论面前的天字第一号的问题。BMKI研究的结果多少有点令人沮丧，但也可以说是令人鼓舞的。BMKI的发现或结论主要有：

1.        相对低维空间的事物的行为永远无法彻底解释相对高维空间的事物行为。就像从孤立地生活着的个人的行为无法理解人与人之间的友谊，爱情，赠与，剥削，借贷，仇恨，地位，荣耀，羞辱，嫉妒等社会现象一样。
2.        高维空间中确实包含了低维空间或元素，并且低维空间事物行为可对高维空间事物造成影响，还可以解释高维空间的某些现象。例如血压，血脂（HDL，LDL，VLDL，TG等），肝功能（GPT，GOT，TBil，DBil等）,肾功能（GFR，CREA，UREA，BUN等）的行为可解释机体的健康状态和行为（这种解释本质上是现象学的而不是在严密的逻辑体系推理）。一旦离开了全身机体这一超高维空间舞台，这一切均没有意义。

3.        我们知道，机体高维空间舞台由物理世界进化而成。由于逻辑思维的固有缺陷，各个进化层次都存在着认知所无法跨越的“认知沟壑”，我们只能“无条件承认”这些事实但无法彻底理解和解释从粒子规律到生命规律的转化过程。这些结论多少有些令人沮丧。

4.        逻辑的终极根据是现象学发现，是映射关系，因此BMKI认为“映射是神圣的”。逻辑无法实现从低维空间向高维空间的理论转化（只能“跃迁”）。“高贵的”理论是脆弱的，是现象学的点缀；“平凡的”现象学是强大的，是理论的支柱。

5.        本质上由现象学和映射支撑起来的生命科学（主要是生物学和医学）大厦的知识整合有赖于信息学技术的崛起，生物医学信息学处理映射问题强而有力，是生物医学知识整合的“救世主”。这就是我们为什么说结论也是令人鼓舞的。
（详见包含飞著:《生物医学知识整合论》（浙江大学出版社出版））

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我有放在床头看

老包

《生物医学知识整合论》概念体系


第二章“关于知识本性的讨论”概念体系

1. “知识二元论”的基础概念和基本命题
   1.1 内省性知识
        1.1.1 内省性基础知识
        1.1.2 内省性科学知识
        1.1.3
        ***意识性对象\有限性，封闭性，必然性，可预测性，意识力，自身反指性，无穷性合理性

   1.2 外省性知识
        1.1.1 外省性基础知识
        1.1.2 外省性科学知识
        ***物理性对象\开放性，意外性，偶然性，不可预测性，物理力，自身排除性，无穷性不合理性，物理准无穷性

1.3 二元论的相关议题
1.3.1 物性，意性，形式系统，物理系统，人工智能型Ⅰ问题，人工智能型Ⅱ问题，二元论与知识确定性的关系，确定性与不确定性的相互转化，
逻辑超脱物理世界轻松一面（随意性），逻辑回归物理世界沉重一面（制约性）：
1.3.2命题的确定性
命题的确定性的影响因素：主体的存在域（资源库，类资源），有效域（有效资源，有关的类资源：胜任的医生）；客体的存在域，作用域；谓词的物理指定程度→认知负荷→确定性风险
1.3.3 is-a命题的确定性和认知负荷与客体的抽象程度有关
1.3.4知识的不确定之由来
物理世界固有的开放性，永恒的意外性确定了关于物理世界知识的永恒的不确定性（确定性只有形式世界或逻辑世界中存在），不确定性形式有：
**随机性：因果决定性链中存在暗环节，无法完全掌握过程，只能观察结果，其结果只能由现象学决定；
**混沌性（随机决定性）；
**抽象到具体的不确定性
**连续性和可分性的冲突（边界模糊性）
1.3.5系统从不确定到可确定，从不可推导到可推导的转化，认知目标的决定性，准形式系统（准形式空间的建立）；

   1.4知识的粒度运算
1.4.1 基本粒度：空间粒度，时间粒度，过程粒度，机制粒度，概念粒度，相对粒度，合理（合适）粒度，粒度选择和判断

1.5知识的粒度运算知识背景探讨
1.5.1图林试验与知识背景：导致给知识对象的原因，与该知识对象有关的人类意愿；
1.5.2知识背景的类型：结构破坏性知识背景，灰色或半清晰知识背景，白色或全清晰知识背景，等价知识背景，常识性知识背景，
1.5.3知识背景操作：用对照试验获取知识

老包

关于医学知识和数据的科学，在医学信息学的真正的生物医学知识工程中，我们将会遇到那些重要概念……

第三章 “认知和逻辑”概念体系

***知识的生成驱动力：好奇性和功利目的，反映了知识的物性和诗性。
***知识的性质分类：（1）因果关系（物质（性质）和力决定的知识）；（2）时空关系（时空性决定的知识）；（3）抽象-物理指定：分类和推理（认知意识力决定的知识，相对严格的事物联系）；（4）联想-类比（认知意识力决定的知识，相对不严格的事物联系）。
***认知目标论：认知目标的定义以及与确定性的关系；知识目标的界定（划分和选定）。
***知识效率论：认知负荷，相对认知负荷（容易确定），绝对认知负荷（难于确定）;
知识粒度：（1）抽象性粒度（抽象程度越高，粒度越粗，如“水果”的粒度粗于“苹果”的粒度）（各成员的“或”关系，粒度与认知负荷成反比，也即粒度越粗，认知负荷越小，“他得了肺病”与“他得了肺结核”）；（2）局整关系粒度（整个桃子的粒度粗，其桃仁的粒度细）（各成员的“与”关系，粒度与认知负荷成正比，粒度越粗，认知负荷越大，“长江某江段已有污染”与“长江所有江段均有污染”）。
***知识的认知贡献：物理指定程度：指定的对象粒度越细，认知贡献越大。
***认知与推理：：在三段论中，如小项不变，则大项越大（抽象性粒度越粗），认知贡献越小；如大项不变，则小项越大（抽象性粒度越粗），认知贡献越大。对一个三元信息单元，变量或谓词越大（抽象性粒度越粗），认知贡献越小；在三段论中，大前提的认知贡献越大，推理所需的认知负荷越小；反之亦然。
***认知负荷相对性：同一命题，在不同的认知环境或认知目标下，其认知负荷可以不同。
***公理相对性研究：宏微尺度决定可导致公理的转化（一个公理转化到其反面）。一对非等价体经反复地由宏及微地演化，就可能成为一对等价体，这并非天方夜谭，这其实在我们的认知世界中是允许的并经常实行的。
***噪声与信号的转化的一般规律：我们的临床数据变化反映的是仅仅是一般无意义的随机噪声还是某种健康或疾病信号？
***太湖石体积之谜：物理运算的技巧：体积等价性-维度异价性问题导致复杂问题的转化和简化，复杂性规避，可观测等价参量的探索和设计。
***认知的不完备性原理：人类认知的固有弱点研究。
***认知相左原理：物理世界总能例举例外事例否定我们公认的认知原则。
***新生儿感知觉发展原则（认知原动力）的探讨：生存，愉悦，求知，干预，自我价值体现，交流，自由，经济，渐进性（由近及远，由直接到间接，资源占有，分化，整合等原则。这些因素参与我们的生物医学知识数据工程吗？
***逻辑惯性是人类思维的基本元轨道，它也是一种悖论之源，其本身往往是一个元悖论：一个整体总是含有部分，一个部分总是含有更细的部分，……→一个棍子总是含有更细的棍子，……→最后我们可以获得一条直线（欧氏直线），它无高无宽，它不可再分）。
***三段论推理的信息学思考：
（1）何谓抽象级推理，物理级推？
（2）何谓原指性？物理个体指定性。
（3）何谓原性律？对定义本身进行推理。
（4）何谓全域排中律？全域性为排中性的前提。
（5）何谓原指律？小前提和结论的主体是物理对象。
（6）何谓原谬律？由某个定义属性决定的存在竟不含有该属性。
（7）何谓自指性和他指性？
***集合论
：存在与虚无等价性（实集合和“空集合”都是集合）；
***多体问题看机体：一体问题→二体问题→三体问题→运算指数式爆炸（理性和理解的消失-现象学主导性及其合理性）→机体万体问题――－问题：为什么生物医学现象学的天下？
***机体-生物学-医学如何挑战亚里士多德的基本逻辑规律：同一律，矛盾律，排中律
***能势分析：势壑-中心势位-势壑区临床等价性；势壑与机体容错性和纠偏能力。――－问题：如何在临床数据分析中实现能势分析？
***势壑溢出与突变，认知目标与临床等价异价性。――－问题：如何对疾病的动力学进行能势分析？
***机体的柔性逻辑和硬性逻辑，柔性逻辑与硬性推理，推理爆炸和运算爆炸；柔性逻辑的域值与经典数学的数值。
***抽象与指定运动：（1）物性实体与意性实体（或概念实体），定义属性集合（Definition Attribute Set, DAS），抽象与指定运动的“驱动力”），指定运动体现了物性递增与意性递减。（2）DAS(相对抽象类)－被包含→ DAS(相对类)。（3）DAS的分析和选择原则：（a）各种属性是否存在因果关系或主从关系；（b）可观测性和可确定性;（c）何种属性对对象的影响最大，定义属性排序；
***语境运筹：
（1）一般语境律：抽象程度越高的事物受环境影响越小，反之亦然；（2）知识与“常识语境”的相关性；（3）知识的物质主导性（意味着开放性和联结性）和心智主导性（意味着可封闭性和可离散性）；（4）一般语境律的延伸：抽象程度越高的事物其物质主导性越小，心智主导性越大；反之亦然。
（5）独立性和离散性五阶体系：意指性概念（具有完全的可离散性和独立性，可独立于环境。为完全由心智定义的概念体系，由意识属性定义的概念，它们与具体的物理事物无关，却可以代表一切物理事物）→物指性概念（较弱的和程度不同的可离散性和独立性。为物理定义属性决定的概念，指定相应的抽象程度不同的物理对象）→描述型数据（为准物理系统，不可能真正独立于环境）→真实事物（（一般物理系统：为物理系统，可离散性和独立性较描述型数据更弱）→生物系统或机体（为超复杂物理系统，具高度的环境依赖性和相互联结性）
***联想的信息学分析