“体内宇宙，星转斗移”

老包

B.

“体内宇宙，星转斗移”：机体的循环模型的时间同步整合（time-synchronous integration，TSI）
此为一种初级的机体功能态的时间循环数据的整合。gci = fi(t- t0), i =1,2,3,…，gci表示肺容量-时间循环，左心室容量-时间循环，血糖浓度-时间循环等。可表达为离散的形式，也可表达为连续的形式，t0为一人为决定的共同时间起点，它决定了各循环的起始相。设Gc为机体的状态-时间循环函数的时间同步整合即协调共存状态，I为广义的各循环之间的包括生物学强度和频率在内的协调共存整合算子，那么Gc = I（gci）, i =1,2,3,…，为一种机体的循环模型的时间同步整合性数字虚拟人（见下文）。如果In∈I分别为正常人体各循环机制的平均态强度或平均频率协调共存，上下限态强度或上下限频率协调共存，时相和态相协调共存等整合算子等，如呼吸率-心率比的生物学要求以及上文所举“等容收缩相”一例中“心房进入舒张期后不久，心室开始收缩，…”（一种“态相协调共存”）。机体的循环模型的TSI =In(gcj),j =1,2,3,…,n = 1,2,3…就是一系列整合意义下的正常-异常判别算子。
图3为标准机体的生物循环协调共存性整合示意图，这些循环可以是呼吸、心搏、生殖等周期。一般情况下序参量为时间。图中t0为人为决定的统一起点时间（决定各循环的起始相），tc为该循环的周期时间，t为普通时间（即时时间），n=Int((t-t0)/ tc)为t0到t的已计循环次数 ，第i循环t时刻的即时状态为gi = fi(t-(t0+tcn)),t时刻的各循环的即时总状态G= I（gi）, i=1,2,3,…

摘自:包含飞:"生物医学知识整合论（Ⅶ）"(图3为线框图,拜托农夫想法贴上去)

dreamaster

上贴附图：

老包

谢谢农夫!

老包

[B]难以理解？没有意义？难以实现？......


Say something![/B][/SIZE] [/FONT][/COLOR]

he3kulai

在理解数据中要使用OLAP模型概念；
60年代，关系数据库之父E.F.Codd提出了关系模型，促进了联机事务处理(OLTP)的发展(数据以表格的形式而非文件方式存储)。1993年，E.F.Codd提出了OLAP概念，认为OLTP已不能满足终端用户对数据库查询分析的需要，SQL对大型数据库进行的简单查询也不能满足终端用户分析的要求。用户的决策分析需要对关系数据库进行大量计算才能得到结果，而查询的结果并不能满足决策者提出的需求。因此，E.F.Codd提出了多维数据库和多维分析的概念，即OLAP----定义1 ：OLAP(联机分析处理)是针对特定问题的联机数据访问和分析。通过对信息(维数据)的多种可能的观察形式进行快速、稳定一致和交互性的存取，允许管理决策人员对数据进行深入观察。定义2 ：OLAP(联机分析处理) 是使分析人员、管理人员或执行人员能够从多种角度对从原始数据中转化出来的、能够真正为用户所理解的、并真实反映企业维特性的信息进行快速、一致、交互地存取，从而获得对数据的更深入了解的一类软件技术。(OLAP委员会的定义)；OLAP的目标：是满足决策支持或多维环境特定的查询和报表需求，它的技术核心是“维”这个概念，因此OLAP也可以说是多维数据分析工具的集合。


上面2楼的图表试图以椭圆的圆形视觉恢复构建三维空间模型，其实在数据挖掘中是很容易实现的；下面列举5个概念：
1.维：是人们观察数据的特定角度，是考虑问题时的一类属性，属性集合构成一个维(时间维、地理维等)。
2.维的层次：人们观察数据的某个特定角度(即某个维)还可以存在细节程度不同的各个描述方面(时间维：日期、月份、季度、年)。
3.维的成员：维的一个取值。是数据项在某维中位置的描述。(“某年某月某日”是在时间维上位置的描述)
4.多维数组：维和变量的组合表示。一个多维数组可以表示为：(维1，维2，…，维n，变量)。(时间，地区，产品，销售额)
5.数据单元(单元格)：多维数组的取值。(2000年1月，上海，笔记本电脑，$100000)
上述结构用在更快速的实时信号分析中时，采用小波技术做FFT变换进行信号确认；在小波分解时有构建比较完美的小波基的任务；我现在可以列举的比较完美的小波基是“仁义理智信”分析社会形态学信号。



OLAP多维数据结构：
1.超立方结构(Hypercube)
超立方结构指用三维或更多的维数来描述一个对象,每个维彼此垂直。数据的测量值发生在维的交叉点上,数据空间的各个部分都有相同的维属性。(收缩超立方结构。这种结构的数据密度更大,数据的维数更少,并可加入额外的分析维)。
 2.多立方结构(Multicube)
即将超立方结构变为子立方结构。面向某一特定应用对维进行分割, 它具有很强的灵活性,提高了数据(特别是稀疏数据)的分析效率。


OLAP多维数据分析方法：
1.切片和切块(Slice and Dice)
在多维数据结构中,按二维进行切片,按三维进行切块,可得到所需要的数据。如在“城市、产品、时间”三维立方体中进行切块和切片,可得到各城市、各产品的销售情况。
2.钻取(Drill)
钻取包含向下钻取(Drill-down)和向上钻取(Drill-up)/上卷(Roll-up)操作， 钻取的深度与维所划分的层次相对应。
 3.旋转(Rotate)/转轴(Pivot)
通过旋转可以得到不同视角的数据。


OLAP可实现性：
1.快速性:用户对OLAP的快速反应能力有很高的要求。系统应能在5秒内对用户的大部分分析要求做出反应。 
2.可分析性:OLAP系统应能处理与应用有关的任何逻辑分析和统计分析。
3.多维性:多维性是OLAP的关键属性。系统必须提供对数据的多维视图和分析,包括对层次维和多重层次维的完全支持。。
4.信息性:不论数据量有多大，也不管数据存储在何处，OLAP系统应能及时获得信息，并且管理大容量信息。


OLAP现实工具：
Hyperion Essbase
Oracle Express
IBM DB2 OLAP Server
Sybase Power dimension
Informix Metacube
Microsoft  Plato
Brio
Cognos
Business Object
MicroStrategy

he3kulai

日立用立体图像表现心脏电流分布

                               
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2004/09/14 详见 http://china.nikkeibp.co.jp/china/news/bio/bio200409140122.html


　　【日经BP社报道】日立制作所在2004年9月9日宣布开发成功了使用该公司“心磁计”技术、根据心脏活动绘制电流分布三维图像的技术。由于可以将心磁计的测定数据重新构筑成心脏的立体模式，对整个心脏进行观测，因此可以从多种角度判断心脏疾病的机制。9月13、14日两天，将在京都召开的第21届日本心电学会学术会议上发表这一技术。



　　心磁计是通过特殊传感器检测心脏活动在体表形成的微小磁场、从而了解心脏活动的技术，是由日立开发并投产的。可以在直接穿着衣服、不给身体造成负担的情况下，短时间内迅速测定。另外，与心电图是测定心脏正面的数据不同，心磁计的特点是可以从背面进行检查，但这样很难直观地掌握情况。此次日立制作所中央研究所开发了两项技术，在平均性心脏模式下，成功地通过心磁计将心脏的活动状况用图像表现出来。一项是以心脏内部的一定部位为基准，使心磁图数据与心脏模式的位置吻合起来的计算方式“标准心脏模式位置吻合技术”。另一项是对与心脏距离不同、磁场强度也不同的心磁图数据进行修正，流畅地显示三维电流分布的“电流分布合成技术”。

　　这样在观察健康者的心脏时，可以在不同的时间从正面（右心房）与背面（左心房）确认心房的电磁活动。日立制作所表示可以通过三维图像观察整个心脏的电流变化、详细了解电磁信号与心脏部位的关联情况。该技术今后将应用于分析心脏疾病机制等。（记者：远藤 刚＝infostand）

老包

最初由 he3kulai 发表
[B]上面2楼的图表试图以椭圆的圆形视觉恢复构建三维空间模型，其实在数据挖掘中是很容易实现的；下面列举5个概念：
1.维：是人们观察数据的特定角度，是考虑问题时的一类属性，属性集合构成一个维(时间维、地理维等)。
2.维的层次：人们观察数据的某个特定角度(即某个维)还可以存在细节程度不同的各个描述方面(时间维：日期、月份、季度、年)。
3.维的成员：维的一个取值。是数据项在某维中位置的描述。(“某年某月某日”是在时间维上位置的描述)
4.多维数组：维和变量的组合表示。一个多维数组可以表示为：(维1，维2，…，维n，变量)。(时间，地区，产品，销售额)
5.数据单元(单元格)：多维数组的取值。(2000年1月，上海，笔记本电脑，$100000)
上述结构用在更快速的实时信号分析中时，采用小波技术做FFT变换进行信号确认；在小波分解时有构建比较完美的小波基的任务；我现在可以列举的比较完美的小波基是“仁义理智信”分析社会形态学信号。



OLAP多维数据结构：
1.超立方结构(Hypercube)
超立方结构指用三维或更多的维数来描述一个对象,每个维彼此垂直。数据的测量值发生在维的交叉点上,数据空间的各个部分都有相同的维属性。(收缩超立方结构。这种结构的数据密度更大,数据的维数更少,并可加入额外的分析维)。
2.多立方结构(Multicube)
即将超立方结构变为子立方结构。面向某一特定应用对维进行分割, 它具有很强的灵活性,提高了数据(特别是稀疏数据)的分析效率。


OLAP多维数据分析方法：
1.切片和切块(Slice and Dice)
在多维数据结构中,按二维进行切片,按三维进行切块,可得到所需要的数据。如在“城市、产品、时间”三维立方体中进行切块和切片,可得到各城市、各产品的销售情况。
2.钻取(Drill)
钻取包含向下钻取(Drill-down)和向上钻取(Drill-up)/上卷(Roll-up)操作， 钻取的深度与维所划分的层次相对应。
3.旋转(Rotate)/转轴(Pivot)
通过旋转可以得到不同视角的数据。
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[B]
非常好！

我将提供关于楼2图的一些假想数据集合。[/B][/SIZE]

楼2图其实仅仅是某种关系库的直观化模式图，并非“恢复构建三维空间模型”。

老包

[B]科学的灵魂是探索和创新！[/B][/SIZE] [/FONT] [/COLOR]

老包

[B]来点朝气，来点探险精神，七老八十岁当老头老太也不迟。[/B][/SIZE] [/FONT]  [/COLOR]

老包

（二楼）图为一种功能性虚拟标准人体，在认知科学上可认为是一种非理解性表达。我们的生物医学知识整合也可以从这里开始。

生理机制的表示可以为连续的形式,也可以为离散的的形式。如果采样粒度达到一定的要求，那么一个生理循环机制就可以用离散的数据集合表示，而无需用连续的算法表示。

例如以P波的起点为心动周期的起始点，那么一个心动周期的心电图循环可以大致表示为{(0.00,0.000)，(0.12,0.048)，(0.00,0.092)，(0.00,0.16)，(-0.20,0.18)，(0.90,0.20)，(-0.40,0.22)，(0.00,0.32)，(0.17,0.45)，(0.00,0.58)，(0.00,0.80)}。集合的元素是数据对，前者为电压，单位为mV,后者是时间，单位为秒。

心电图循环与心室,心房,主动脉，左冠状动脉，右冠状动脉等的压力循环为（时间或相或因果）态同步，对一个标准机体或同一个实例机体，是可以相互换算的。

又如在一个平静呼吸周期中，肺内压的循环可大致表示为{（0.0,0.0），（-1.2,1.0），（1.2,3.0），（0.0,4.6），（0.0,7.0）},前者为肺内压与大气压之差，单位为mmHg;后者为时间，单位为秒。

呼吸气容量为{(0,0.0), (500,1.5), (500,2.2), (0,5.0), (0,7.0)}, 前者为呼吸气容量，单位为ml;后者为时间，单位为秒。

呼吸周期与肺泡表面活性物质的密度和肺泡表面张力的周期，肺的静态顺应性循环，气道阻力循环等也为（时间或相或因果）态同步。

一般来说，呼吸周期与心搏周期为频率关联，并非时间关联。而其他机制之间往往是以某种生物医学语义相关。

以上数据都可以某种关系化数据库形式表达和存储，以时钟时间-统一起始时间-周期时间-某种线性或非线性平滑算子联合引擎搜索取值或可视化。结合如药物代谢动力学周期性和非周期性诸多机制，就可以为临床观测，估计和决策提供辅助。

摘自《Hanfei Bao：The Theory of Biomedical Knowledge Integration(IV)》

he3kulai

http://sxyxxkx.sdut.edu.cn/sxjm/sxrj.htm

软件名称 相关介绍  大小  下载  
Mathematica 4.2
Mathmatica 是由美国Wolfram公司研究开发的一个数学软件，它提供了与Mathcad和Mathlab这两个著名数学软件同样强大的功能，能够完成符号运算、数学图形绘制甚至动画制作等多种操作。但与它们相比，Mathmatica显得小巧得多。　    46.3MB
  
mathcad 7.0 Mathcad 7.0 是一个运行在Windows 95或Windows NT环境下的标准Windows 应用程序。除了继承早期版本所提供的功能外，还新增了近二十种统计函数及图形类型，提供了循环、转移、嵌套等程序设计功能，满足各种不同的需求。　 　  59.6MB
  
lingo 解非线性规划的数学软件，与lindo属同一公司的系列产品。可运行在Window 95/NT平台下。　  6.9MB
  
lindo 解线形规划的数学软件，可运行在Window 95/NT平台下。　  2.35MB
  
matlab 6.2 MATLAB 语言是当今国际上科学界 (尤其是自动控制领域) 最具影响力、也是最有活力的软件。它起源于矩阵运算，并已经发展成一种高度集成的计算机语言。它提供了强大的科学运算、灵活的程序设计流程、高质量的图形可视化与界面设计、便捷的与其他程序和语言接口的功能。MATLAB 语言在各国高校与研究单位起着重大的作用。　 　  361MB
  
SPSS 11  SPSS(Statistical Package for the Social Science)--社会科学用软件包是世界上著名的统计分析软件之一。 它和SAS(Statistical Analysis System，统计分析系统)、BMDP(Biomedical Programs，生物医学程序)并称为国际上最有影响的三大统计软件。 　  65.2MB   
origin 5.0  Origin是Windows 平台下用于数据分析、工程绘图的软件。它的功能强大，在各国科技工作者中使用较为普遍。5.0 版中又新增加了一些功能，如全面支持鼠标右键操作、支持拖放式绘图等等。  5.61MB   
scientific notebook 3.0  Scientific notebook 是Scientific word 的升级版，有内置式的符号运算工具，能作图，推演公式。输出格式为latex（ 国际通用的稿件投寄格式) 。公式输入极为方便 19.2MB  

SAS V9.0

he3kulai

如来告诉阿难：我就用尘俗事物的道理来解除你的疑惑。如来佛实时就令罗侯罗敲一下钟，然后问阿难：你听到了吗？阿难和大众都说：我们听到了。钟声停止后，佛又问：你听到了吗？阿难和大众都回答：没有听到。这时，罗侯罗又敲了一下钟，如来又问：你听到没有？阿难和大众都回答：我们听到了。如来问阿难：你说甚么叫做听到？甚么又叫做没有听到？阿难和大家都回答说：钟被敲击发出声音，我们就听得到，声音停息了，我们就没有听到。如来又令罗侯罗敲钟，然后又问阿难：你们现在听到有声音吗？阿难和大家都回笞：有声音。过了一会儿，声音消散了，如来又问到：现在有声音吗？阿难和大众都回答说没有声音。过了一会儿，罗侯罗又来敲钟，如来又问：你们现在有听到声音没有？阿难和大众都回答说有声音。
　　如来佛问阿难：你说说，甚么叫做有声？甚么叫做无声？阿难和大众都回答说：钟被敲击有声音，就叫做有声，敲击停下来钟声散去，就叫做无声。如来对阿难和大众说：你们所说为甚么是自相矛盾的呢？大众和阿难都立即问到：我们所说怎么是自相矛盾的？如来说：我问你们听见没有，你们就回答听见，我又问你们声音，你们就回答声音，在回答之中，将听见和声音混淆不清，怎么不是自相矛盾呢？阿难，声音散了没有声响，你就说听不到，如果真正是听不到，那么你的听闻就已经灭绝了，已经如枯木一般无知无觉了。当钟声又响起，你为甚么又说你听到了呢？你知道有声、无声，都是来自声音尘物，你有时听见，有时没有听见，那里就是你有时有听闻，有时没有听闻。你已经听见了无声却要说没有听见，甚么是没有听见？所以说，声音在听闻中自己有生有灭，并不是因为听闻有时有，有时又没有。你还在颠倒之中，将声音误识为听闻，难怪你会迷惑昏昧，将常住真心误识为断灭之心呢，这确实是不应当啊！