实验性本体是我们论坛施展才华的好领域

老包 · 发表于 2005-10-23 12:58:10

<div class='quotetop'>引用

tqoayve @ 2005-10-23 10:59)</div><div class='quotemain'>包教授,您的邮箱里有贴.</div> 来信已阅, 谢谢。这是很好的建议。我会把思路逐步理清。也希望网友们积极出好点子.

medsoft · 发表于 2005-10-23 13:11:15

支持“包老”领导论坛开展“实验性本体”的研究，如果需要我们的话，只要说一声，我一定积极参加！前段时间思考电子病历结构化与临床决策支持的关系，临床决策支持与知识库的关系，就想过一些这样的问题，现在通过包老的引导，我也意识到开展此类研究的重要价值。

tqoayve · 发表于 2005-10-23 13:29:05

希望包教授相信我的动手能力,这一块我包了. 团队中有什么活动请通过邮箱通知我. tqoayve@yeah.net

老包 · 发表于 2005-10-23 13:48:25

谢谢tqoayve和medsoft 的支持! 我相信论坛一定能组织起一个能攻克各种难题精干团队.我一方面构思一个总体框架,另一方面查索相关资料,有些资料可能会寄给大家,大家分工研究。也希望网友踊跃献计献策。

tqoayve · 发表于 2005-10-23 16:02:16

我是搞临床的(内科).涉及临床的很多专业研究都在取得进步,但这些进步对临床工作影响是有限的.
 
 医生们仍然靠父母给的脑袋工作,很多新知识不能通过医生们的工作让病人受益(人脑功能的局限,难以及时消化或不愿去消化). 这是一个"瓶颈"难题.
 
 抬起头来往未来看,无不感到有一条路是我们必经的,它就是"医学信息学". 这个学科将分流知识爆炸造成的信息淤阻,优化知识传播,强化新医学知识的应用,最大限度地对医生们进行决策支持, 这些影响是划时代的------一个艰巨而伟大的工程!
 
 我代表医护人员期待着它的进步! <div>此帖由 tqoayve 在 2005-10-23 08:10 进行编辑...</div>

medsoft · 发表于 2005-10-23 16:26:41

<div class='quotetop'>引用

tqoayve @ 2005-10-23 16:02)</div><div class='quotemain'>我是搞临床的(内科).涉及临床的很多专业研究都在取得进步,但这些进步对临床工作影响是有限的. 医生们仍然靠父母给的脑袋工作,很多新知识不能通过医生们的工作让病人受益(人脑功能的局限,难以及时消化或不愿去消化). 这是一个"瓶颈"难题. 抬起头来往未来看,无不感到有一条路是我们必经的,它就是"医学信息学". 这个学科将分流知识爆炸造成的信息淤阻,优化知识传播,强化新医学知识的应用,最大限度地对医生们进行决策支持, 这些影响是划时代的------一个艰巨而伟大的工程! 我代表医护人员期待着它的进步!</div> 呵呵，又是一名医生，看来医生对知识还是很敏锐的。而且我们都相信这样能帮助医生给患者提供更好的服务，减少医疗服务中的错误。我感觉医学的三大支柱是：知识，教育和技术。唯有IT能把他们很好的联系在一起，现在我们进行的就是要用信息科学将知识与临床结合起来！

medsoft · 发表于 2005-10-23 16:30:51

<div class='quotetop'>引用

老包 @ 2005-10-23 13:48)</div><div class='quotemain'> 谢谢tqoayve和medsoft 的支持! 我相信论坛一定能组织起一个能攻克各种难题精干团队.我一方面构思一个总体框架,另一方面查索相关资料,有些资料可能会寄给大家,大家分工研究。也希望网友踊跃献计献策。</div>应该是我们感谢包老对我们的关照，要不然我们想做些事，也不知如何去做呢!期待进一步开展研究。

老包 · 发表于 2005-10-24 11:59:51

<div class='quotetop'>引用

medsoft @ 2005-10-23 16:26)</div><div class='quotemain'> 呵呵，又是一名医生，看来医生对知识还是很敏锐的。而且我们都相信这样能帮助医生给患者提供更好的服务，减少医疗服务中的错误。我感觉医学的三大支柱是：知识，教育和技术。唯有IT能把他们很好的联系在一起，现在我们进行的就是要用信息科学将知识与临床结合起来！</div> 建议组织起一个青年医生及医学信息学者医学实验性本体（medical experimental ontology，MEO）研究会，发扬年轻人求知性，求新性，求变性强及对未来学科领域兴趣浓郁的特点。.以求最终使万千生物医学映射关系或机制运转起来。  <div>此帖由老包在 2005-10-24 21:54 进行编辑...</div>

tqoayve · 发表于 2005-10-24 19:10:39

一个充满希望的领域,一个可以挥洒激情的领域.足以成为年轻人为之奋斗一生的目标!
 理性地支持!

medsoft · 发表于 2005-10-24 21:56:05

<div class='quotetop'>引用

老包 @ 2005-10-24 11:59)</div><div class='quotemain'>  建议组织起一个青年医生医学实验性本体（medical experimental ontology，MEO）研究会，发扬年轻人求知性，求新性，求变性强及对未来学科领域兴趣浓郁的特点。.以求最终使万千生物医学映射关系或机制运转起来。 </div>可行，但实施难度很大，现在的人越来越现实，很少很真正沉下心来做研究，而且确实前途未卜！

老包 · 发表于 2005-10-24 22:02:13

23楼建议成立"青年医生医学实验性本体（medical experimental ontology，MEO）研究会"改为建议成立"青年医生和青年医学信息学者医学实验性本体研究会"（二青学者MEO研究会），因为相信在研究一定会遇到复杂的系统学和信息学问题。两类青年学者应携手共创未来。

medsoft · 发表于 2005-10-24 22:41:14

<div class='quotetop'>引用

老包 @ 2005-10-24 22:02)</div><div class='quotemain'>  23楼建议成立"青年医生医学实验性本体（medical experimental ontology，MEO）研究会"改为建议成立"青年医生和青年医学信息学者医学实验性本体研究会"（二青学者MEO研究会），因为相信在研究一定会遇到复杂的系统学和信息学问题。两类青年学者应携手共创未来。</div>更全面了，盼望两者结合能擦出“实验性本体”中灿烂的火花！

tqoayve · 发表于 2005-10-24 22:57:39

又进了一步,这样分工可以使每一个部分都容易些.
 虽然计划是困难的,但困难也是总有方法解决. 车到山前必有路嘛.
 过两天我也要提出一些可能的构想.

老包 · 发表于 2005-10-24 23:10:43

MEO研究:(1)MEO群“同体”动态运转模型研究和开发; 关于这方面,BMKI的一些初步研究有：四．生物医学知识的生物学算子和知识模型  为了强调从数据和知识整合新视角来看生物医学知识的表达和操作，本文把一些生物机制称为广义的生物学算子。很多生物学算子本质上属于人工智能中非解释性或非理解性算子[16]。因为生物系统复杂无比，人们希望对人体系统获得白箱式的了解，就象我们对手表或汽车结构和机制那样了解，即使这一天真的能到来，也需等到“几千几万年”以后。我们当然不能等到“几千几万年”以后再去对生物医学知识进行整合，所以我们不得不首先“无条件地”承认那些目前我们尚不能理解的实验或经验描述性知识或模型。它们输入、输出及依赖条件是我们掌握的全部内容虼宋颐前阉堑作暂时不可分拆的知识单元（量子）。在必要时把这些知识量子作为整合算子，即所?amp;ldquo;生物学算子”。这种做法并不违背认知科学的基本原则，因为即使精确严谨如公理系统，例如欧几里得几何，其最基本的公理和公设集合，也是无条件认可的，是非解释性的，是认知量子和基本推理规则。重要的是，我们有可能因此把知识整合问题的研究提前“几千几万年”。  生物学算子的问题十分复杂，一个可用于运算的算子涉及：（1）特征及其特征值（包括最大值，最小值，平均值等）；（2）函数（或关系）；（3）函数（或关系）生效地点，即覆盖域；（4）输入集合和输入地点；（5）输出集合和输出地点；(6)机制的冗余度或确定度等一系列问题。笔者拟在其他场合再作深入探讨。本文拟对生物学算子的一种类型的知识模型作一探讨。作为知识的一部分，模型与框架一样也属于人类意识范畴，也是在某种人为限定的认知目标下的对客观真实世界的原物的部分提取。与框架不同的是，模型由一组概念（或变量）及其值组成，因此具有有限的物理操作性。下文特别介绍循环型知识模型。  A. 循环型知识模型的类型：在某一序参数下，机制的行为具有周期或反复的特征。循环型模型也可用离散的和连续的二种方法表达。在一定的认知粒度下，机制的离散模型只有有限个状态。  1．时间循环模型的序参量是时间，特点是有固定周期时间。设y = f (t)为一现象学时间函数，如果f (t) = f (t + △t)，则 f(t)为一时间循环函数，△t就是固定周期时间。  2．过程性或关系性循环模型：对一个有序关系（如事物的因果链）f={(xi,xi+1)|(xi,xi+1)∈f并且(xi,xi+1)= (xi+θ,x i+1+θ)}，θ为一个正整数，那么f称为过程性或关系性循环模型。  B. “体内宇宙，星转斗移”：机体的循环模型的时间同步整合（time-synchronous integration，TSI）  此为一种初级的机体功能态的时间循环数据的整合。gci = fi(t- t0), i =1,2,3,…，gci表示肺容量-时间循环，左心室容量-时间循环，血糖浓度-时间循环等。可表达为离散的形式，也可表达为连续的形式，t0为一人为决定的共同时间起点，它决定了各循环的起始相。设Gc为机体的状态-时间循环函数的时间同步整合即协调共存状态，I为广义的各循环之间的包括生物学强度和频率在内的协调共存整合算子，那么Gc = I（gci）, i =1,2,3,…，为一种机体的循环模型的时间同步整合性数字虚拟人（见下文）。如果In∈I分别为正常人体各循环机制的平均态强度或平均频率协调共存，上下限态强度或上下限频率协调共存，时相和态相协调共存等整合算子，如呼吸率-心率比的生物学要求以及上文所举“等容收缩相”一例中“心房进入舒张期后不久，心室开始收缩，…”（一种“态相协调共存”）。机体的循环模型的TSI =In(gcj),j =1,2,3,…,n = 1,2,3…就是一系列整合意义下的正常-异常判别算子。  图3为标准机体的生物循环协调共存性整合示意图，这些循环可以是呼吸、心搏、生殖等周期。一般情况下序参量为时间。图中t0为人为决定的统一起点时间（决定各循环的起始相），tc为该循环的周期时间，t为普通时间（即时时间），n=Int((t-t0)/ tc)为t0到t的已计循环次数，第i循环t时刻的即时状态为gi = fi(t-(t0+tcn)),t时刻的各循环的即时总状态G= I（gi）, i=1,2,3,…  -----包含飞：生物医学知识整合论（Ⅶ），《医学信息》，17（11）:685-692,2004-11-26-----  <div>此帖由老包在 2005-10-25 00:05 进行编辑...</div>

老包 · 发表于 2005-10-24 23:58:22

MEO的重要研究和讨论还包括：（序号延续） （2）MEO研究和开发是否可能发轫于中国? 初始权是否只能乖乖地拱手让人？（最痛苦的研究） （3）临床急需或实用的MEO类型调查，疑难杂症的MEO辅助研究； （4）MEO与减少误诊的关系，与克服误诊相关的MEO类型调查； （5）MEO与个体知识或信息（如电子病历）的关系； （6）MEO与解剖虚拟人体，生理虚拟人体，病理虚拟人体，药理虚拟人体的关系； （7）生物层次MEO群，中间层次MEO群与临床层次MEO群的结构和关系； （8）MEO群整合理论研究，相关的信息学，系统学和复杂性科学问题研究； （9）实现平台XML-RDF-RDFS-DAML+OIL-OWL实现能力是否足够； （10）是否有可能融入W3框架并努力构成语义web型医学本体事业的半壁江山； （11）分布式数据库研究和整合； （12）资金筹措和团队运行机制： .          资源分内外二块机制:公开共享信息部分+会员制享受部分?            公益方式机制，国内国际环境如何？ …………    <div>此帖由老包在 2005-10-25 00:11 进行编辑...</div>

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