启动生物医学形式结构知识整合工程宣言

dongxi

包教师，我开始有点理解您在干什么了，你举的例很重要。
应该说这种思路是可以实现的。

老包

#操作性形式结构：

定义：在某一操作性目标下（operational object），组成结构的每个单元的变量值都是可指定的或其粒度是足够的。

例如高血压治疗理想结构：

{非裔美国人，收缩压<135,舒张压<80}
{糖尿病病人，收缩压<130,舒张压<80}
{肾病病人，收缩压<130,舒张压<80}
{其他一般人，收缩压<140,舒张压<90}

[ 本帖最后由 老包 于 2007-2-26 10:00 编辑 ]

老包

石头等应该拿出少帅之气魄来。 现在的世界已不再是封闭了,“该出手时就出手”，何必非得坐等西方学者做出成果，我们再亦步亦趋地跟在后面呢？！

[ 本帖最后由 老包 于 2007-2-25 18:16 编辑 ]

老包

#势态测定形式结构类型Ⅰ

状态定义：事物固定的观测和描述。

势态定义：事物难以观测和描述的变化趋势和方向。

事物势态测定形式结构类型Ⅰ：{（1）偏离（平均数）频率；（2）偏离（平均数）幅度；（3）偏幅面积（偏离幅度与偏幅持续时间的复合）。}

举例:

病人在诊所接受医生检查时会因为害怕或担心健康有问题可导致紧张或焦虑，后者可以引起血压升高。这种初次到医生办公室常见的假性高血压，在以后重复检查时会消失。这现象被形象化地称为“白大衣高血压”。事实上，有人被认为中等程度高血压人群中约四分之一的人在离开了医生办公室后血压就会正常。所以诊断为“白大衣高血压”可能意味着没有临床重要性。
然而白大衣高血压的诊断并非必定是无害的。因为其他原因引起的精神紧张也可能导致血压升高，并且往往无法测定。利用血压计或连续检测装置在家庭中进行监护有助于估计血压升高的频率和持续时间。此外，实行合适的高血压并发症检测有利于帮助评估变化性血压升高的意义。

[ 本帖最后由 老包 于 2007-3-4 12:48 编辑 ]

老包

定义一个“或或加”算子⊕：当操作数A,B,C,…任何两个或两个以上不同时存在，则⊕相当于逻辑∨；当操作数A,B,C,…任何两个或两个以上同时存在，则⊕相当于效能+。

则高血压生成势=基因因素⊕肥胖⊕缺少运动⊕摄盐过多⊕高年龄化。

老包

Commenced!


http://www.miforum.net/bhf/english/yitong2/callhyper.html

表述最基本的形式结构：


Ⅰ类形式结构(数值命题)：
变量(of 载体)↑n—is—（数值性）变量值

[ 本帖最后由 老包 于 2007-9-9 18:50 编辑 ]

老包

我的一个学生将在医学实验性本体的研究方面获得实质性进展！

老包

整合论一书已进入整理阶段，理论探索将告一段落。请大家关注BMKI的：

关于高血压的可计算知识资源（the Computable Knowledge Resources, CKR）的开发和研究：

http://www.miforum.net/bhf/english/yitong2/calresource.html

老包

此专题酝酿多年，但近几年忙于理论探索，一直没有实质性的启动。事实已告诉我们，这几年的袖手旁观只是白白浪费时间，论坛只会越来越失去活力，机会永远不会从天而降。希望论坛上的有志之士（如medsoft,linforest等）也能积极参与进来，为医学信息学事业作出一些实质性贡献。

先把背景贴在下面：

The background logic of the program
The fundamental propositions of this logic are:
(1) A HIS or EHR without the domain knowledge support would be “a kind of layman” in medical practices.

(2) A Information System would be “a kind of illiteracy” facing to the knowledge presented in free text;
(3) The HISs or EHRs are growing continually and rapidly,remaining “a kind hot spot” for investment;
(4) HIS or EHR would be “a kind of patient with malnutrition”, if we would not feed them formatted domain knowledge.

翻译： 项目的背景逻辑
该逻辑的基本命题包括：

（1） 没有领域知识支持的HIS与EHR对医学实践是一种“门外汉”；
（2）一个信息系统面对自然文本表达的知识是一种“文盲”；
（3）HIS与EHR将持续快速发展，继续成为一种“投资热点”；
（4）如果我们不为其提供格式化领域知识，HIS与EHR将患上一种“知识性营养不良症”。

[ 本帖最后由 老包 于 2008-5-27 05:49 编辑 ]

chinaxy

高血压可分为原发性高血压与继发性高血压，版主所讲的高血压病因应该是原发性高血压的病因，请问“原发性高血压”在此要不要做特别标明？
楼主说：
（1）高血压病因—年龄；
（2）高血压病因—食盐量；
（3）高血压病因—体重—肥胖；
（4）高血压病因—遗传因素—有家族史；
（4）高血压病因—工作因素—脑力劳动过度紧张。
医学上高血压的病因现在还不十清楚，教科书上说到超重、食盐摄入、饮酒等因素时用的是相关易患因素，显然易患因素与病因不能相等。
教科书上归纳高血压病的易患因素时，总结为两种：遗传与环境因素。为什么楼主的高血压病因中只重点标明遗传因素而不提环境因素呢？

本人愚见，信手涂鸦，愚钝之处还望专家教诲？

chinaxy

什么是可计算知识资源（the Computable Knowledge Resources, CKR），能否更详细一点？

老包

谢谢chinxy的关心！CKR必须包括3个步骤：（1）知识的格式化表达；（2）算法的建立；（3）程序或接口的开发。由于医学知识极端复杂，当前流行的RDF或OWL等方式恐难以充分覆盖，故而才有我的CKR一说。如果你涉及过知识工程的内容，就明白“（1）知识的格式化表达”最为困难的。有了（1），（2）（3）就好说。对于医学知识的格式化表达，我这里只有一些初步的研究，公布如下：

The followings are the CKEFs primarily identified and their instances:
TypeⅠis sub-classified based on a set of BPSRs.
TypeⅠ-1: subject (variable) causes object (variable)
***the hardening of the arteries causes widening of the pulse pressure.
TypeⅠ-2: subject (variable) increases object (variable)
***increase of the systolic ∧/∨ diastolic blood pressure increases risk of heart disease, kidney disease, hardening of the arteries, eye disease and stroke.
TypeⅠ-3: subject (variable) hardens object (variable)
***isolated systolic hypertension hardens the arteries
TypeⅠ-n: subject (variable) affects object (variable)
***Isolated systolic hypertension mainly affects older people
TypeⅡ-1: The features or symptoms of disease include the list of object (variable)
***The features or symptoms of isolated systolic hypertension include widening of the pulse pressure.
Type II-2: The health care methods of an illness include the list of object (variable)
***the health care methods of borderline hypertension include continuing follow-up of blood pressure and monitoring the complications of hypertension
Type Ⅲ-1: Variable O/W is（digital）Value
***blood pressure of Pre-hypertension is between 120/80 and 139/89 mmHg
Type Ⅲ-2: Variable O/W is defined as (∧/∨)Variable O/W
***Isolated systolic hypertension is defined as a systolic pressure above 140 mmHg ∧a diastolic pressure below 90 mmHg.
***Arteriosclerosis is defined as the progressive thickening and hardening of the walls of medium-sized and large arteries.
***The systolic blood pressure is defined as the maximum of blood pressure in the arteries.
***The diastolic blood pressure is defined as the minimum of blood pressure in the arteries.
Type Ⅲ-3: Variable O/W is greater than Variable O/W, domain
***The risk of systolic hypertension is greater than the risk of diastolic hypertension for persons domainlder than 50 years of age
Type Ⅲ-4: Variable O/W is equal to or less than Variable O/W
***Normal blood pressure is equal to or less than 120/80 mmHg
***ideal blood pressure of patients with chronic kidney diseases or with diabetes is equal to or less than 130/80 mmHg
Type Ⅲ-5: Variable O/W is equal to or greater than Variable O/W
***blood pressure of high blood pressure is equal to or greater than 140/90 mmHg
Type Ⅲ-6: Variable O/W is double Variable O/W, domain
***The risk of cardiovascular disease of a blood pressure is double the risk of cardiovascular disease of that blood pressure + 20/10 mmHg, domain: from 115/75 to

Where O/W means（of InfoHost）n  or (∧with variable )

[ 本帖最后由 老包 于 2008-5-31 01:20 编辑 ]

老包

“病因”一词的医学认知学内涵十分复杂，三言两语难以说清，对CKR这种工程，应多讨论其思想和前景。例如其提出的背景逻辑是否合理？是否有其他方法取代？可行性又如何？......

chinaxy

谢谢！所举的例子与RDF的三元组（x,P,y）格式有点像，即通过二元谓词P将x与y关联起来，这点与楼上所举的例子很像。虽然一般称RDF为一种“语言”，但它与一般的计算机语言完全不同，更像一个格式固定的数据模型。由于RDFS是定义RDF模型所需要的词汇，如所有的二元谓词P都是关于某一领域的特定术语，如楼上所举的医学中的高血压领域。因此楼上的知识格式表达是否可以用RDFS？OWL是在RDFS基础上的扩展，克服了一些RDFS在表达能力的局限性，网上还说它是标准的本体语言。为什么楼上说“当前流行的RDF或OWL等方式恐难以充分覆盖”？版主是否可以详细解释一下CKR与RDF、OWL相比具有什么优点。（我对RDF与OWL也是一知半解，也有可能理解有误。）

chinaxy

例子我没有详细研究，有时间我一定好好看看，在这里学到了不少东西。